参保人住院治疗后，按照正常的报销顺序，医院会先直接通过医保通道扣除医保统筹账户内报销的部分，剩余部分由参保人通过个人医保账户内的资金进行支付，个人医保账户内资金不足的，再通过个人资金支付。如果被保人还购买了百万医疗险，会将被保人个人医保账户内的支付部分以及个人资金支付部分视为被保人的个人支出，同时纳入报销范围，一并报销。
需要注意的是，医保能报销的范围是有具体要求的，按照医保目录来看，医保能够报销的范围包括要求的药品目录、诊疗项目目录以及医疗服务设施标准目录内所产生的基本医疗费用，而且医保也有起付线、封顶线以及报销比例等，所以能够报销的有限，例如一些昂贵的自费药或自费项目，起付线以下的费用，交通意外医疗的费用，均不在社保的报销范围内，但是百万医疗可以报销。
百万医疗险和医保可以一起报销被保人的医疗费用，但是在理赔过程中，需要遵循“先医保后百万医疗险”的顺序进行报销。百万医疗险可以报销的费用包括医保个人账户内支付的部分以及社保报销范围外的费用。